神明大廳
福海宮神明大廳的主神為天上聖母媽祖,千里眼和順風耳則為媽祖駕前首席左護駕,又稱金精將軍和水精將軍,他們同為媽祖駕前的首席護衛,媽祖每一次出巡都可見到祂門在前開道。 神明大廳主神的左邊供奉福德正神土地公。
主神的右邊奉祀的是「註生娘娘」,「註生娘娘」是主司生育的神,也是專門保護孕婦、產婦和幼兒的神。
圓通寶殿
福海宮圓通寶殿主供俸觀世音菩薩,亦有稱圓通古佛,觀世音菩薩又稱為「觀音佛祖」,「觀音」是法號,而「佛祖」則是中國對佛的尊稱。
圓通寶殿左右佛龕供奉十八羅漢。
凌霄寶殿
福海宮凌霄寶殿殿正龕供奉玉皇大帝、三官大帝、太陽星君與太陰星君。 凌霄寶殿殿左廂神房供奉三教聖人(即三教教主),太上老君(道教始祖)、釋迦牟尼佛、至聖先師(儒教始祖)。 凌霄寶殿殿右廂神房供奉五方大帝(即五斗星君)。
財神殿
王功福海宮後殿二樓,圓通寶殿前衛左廂神殿為財神殿,財神殿主供奉文財神爺比干,可供信眾祈求功財利,祈求財神賜財;財源廣進,人人康富;家家美滿、安和樂利。
文昌殿
王功福海宮後殿二樓,圓通寶殿前衛右廂神殿為文昌殿,文昌殿主供奉文昌帝君張亞子,可供信眾祈求功名,祈求者可得智慧增長,學業進步金榜題名,攻明顯達文運亨通。